Vznik učňovskej školy umožnili podstatné zmeny charakterizujúce politickú a verejnú správu v Pezinku po oslobodení. Snahy správy mesta o získanie škôl druhého stupňa boli realizované v roku 1951, keď v budove (Palugyayovská kúria - Revolučná ulica č. 6, dnes Ul. M.R.Štefánika č. 9) vznikla pre potreby Západoslovenských tehelní v Pezinku Odborná škola tehliarska a tehliarsky učňovský domov. Základná odborná škola tehliarska ako škola podniková začala svoju činnosť s oneskorením jedného mesiaca, t.j. 1. októbra 1951. Tento oneskorený začiatok vyplýval z organizačných a technických príčin, pretože škola ako jediná tohoto druhu v republike nemala ani osnov, učiteľov ani riaditeľa školy. V škole bola jedna trieda - vyučovali iba externí pracovníci - zamestnanci Západoslovenských tehelní a učitelia Strednej školy v Pezinku.
Od roku 1955 prešla škola z rezortu stavebníctva pod rezort školstva. V roku 1958 sa škola zmenila na Závodnú učňovskú školu v Pezinku. V roku 1960 dostala škola názov Učňovská škola Pezinok. Škola postupne rozširovala škálu učebných odborov a zameriavala sa na výuku učňov pre podniky z okolia. V rámci prestavby výchovno - vzdelávacej sústavy začína od 1. septembra 1979 pôsobenie Stredného odborného učilišťa, učilišťa pre teoretické vyučovanie, ktoré vzniklo z doterajšej Učňovskej školy v Pezinku. Zriaďovateľom bol Západoslovenský KNV, z ktorého boli zriaďovateľské funkcie delimitované na Drevoindustriu n.p. Žilina 1.9.1987. Názov školy sa zmenil na Stredné odborné učilište drevárske. Od 1. septembra 1980 vznikla Stredná škola pre pracujúcich (SŠP) - dvojročné štúdium popri zamestnaní s maturitou. V roku 1984 vzniklo v Pezinku SOU stavebné. Časť žiakov a pedagogických pracovníkov prešla na nové SOU. V roku 1989 bola škola delimitovaná z Drevoindustrie n.p. Žilina na Západoslovenské nábytkárske závody n.p. Bratislava.
V roku 1990 bola vystavená zriaďovacia listina Stredného odborného učilišťa drevárskeho, ktorého zriaďovateľom sa stalo Ministerstvo lesného a vodného hospodárstva SR. V roku 1991 prebehli ďalšie organizačné zmeny. Škola získala právnu subjektivitu a majetok bol delimitovaný zo ZNZ n.p. Bratislava na SOU drevárske Pezinok. V tomto roku boli delimitovaní aj pracovníci - majstri odborného výcviky zo š.p. Zdroj Senec, zo š.p. Tatra Kopřivnice - autoopravovňa Pezinok. Učitelia boli delimitovaní zo Školskej správy Bratislava VII na SOU drevárske. V súvislosti so zmenou organizácii ministerstiev a ostatných ústredných orgánov štátnej správy v roku 1992 sa zriaďovateľom školy stalo Ministerstvo hospodárstva SR. Pretože prívlastok „drevárske“ v názve školy stratil opodstatnenie, požiadali sme v roku 1993 zriaďovateľa o zmenu názvu školy. Na základe doplnku MH SR k Rozhodnutiu MLaVH sa zmenil názov Stredného odborného učilišťa drevárskeho na „Stredné odborné učilište Pezinok“. Ďalšie delimitácie sa vykonali v roku 1996, keď zo Slovenskej ľudovej majoliky v Modre prešli majstri odborného výcviky pod SOU. Od 1.7.2001 do 31.6 2002 bol zriaďovateľom školy Krajský úrad Bratislava. Od 1.7.2002 je zriaďovateľom Bratislavský samosprávny kraj. Počas päťdesiatročnej histórie školy prešlo školou 328 zamestnancov.